Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms