Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms