Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NipblQ6KCD5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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