Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mre11Q61216 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms