Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdc1Q5PSV9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mdc1Q5PSV9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mdc1Q5PSV9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms