Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trappc1Q5NCF2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trappc1Q5NCF2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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