Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lmod2Q3UHZ5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lmod2Q3UHZ5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmod2Q3UHZ5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lmod2Q3UHZ5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lmod2Q3UHZ5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms