Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkx6-3Q3UHX8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx6-3Q3UHX8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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