Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q08AU9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q08AU9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q08AU9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q08AU9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q08AU9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q08AU9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Q08AU9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q08AU9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q08AU9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q08AU9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms