Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MitfQ08874 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MitfQ08874 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MitfQ08874 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms