Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah2Q06986 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms