Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cmklr1P97468 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cmklr1P97468 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cmklr1P97468 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cmklr1P97468 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms