Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psme1P97371 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Psme1P97371 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Psme1P97371 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme1P97371 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Psme1P97371 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Psme1P97371 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms