Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm2aP59997 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2aP59997 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2aP59997 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms