Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd4P46935 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms