Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms