Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamc1P02468 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms