Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a4O88343 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms