Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb10O35955 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb10O35955 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb10O35955 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb10O35955 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb10O35955 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb10O35955 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb10O35955 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb10O35955 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb10O35955 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb10O35955 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb10O35955 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb10O35955 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms