Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf5O35326 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms