Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna3O08545 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna3O08545 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna3O08545 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna3O08545 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms