Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mfsd4b4J3QNS5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms