Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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Gm20828J3KMI7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Gm20828J3KMI7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Gm20828J3KMI7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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