Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms