Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm4491E0CX42 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm4491E0CX42 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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