Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd4A2AKM2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms