Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms