Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cited4Q9WUL8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited4Q9WUL8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms