Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpv2Q9WTR1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms