Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lhx6Q9R1R0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms