Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 554.4 ms