Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms