Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms