Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx6Q9ER75 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx6Q9ER75 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms