Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx12Q9ER00 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms