Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4933402E13RikQ9D4D2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933402E13RikQ9D4D2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933402E13RikQ9D4D2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933402E13RikQ9D4D2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933402E13RikQ9D4D2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms