Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tspan11Q9D1D1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan11Q9D1D1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms