Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms