Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6bQ99N09 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms