Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clp1Q99LI9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clp1Q99LI9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clp1Q99LI9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clp1Q99LI9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clp1Q99LI9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clp1Q99LI9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clp1Q99LI9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clp1Q99LI9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clp1Q99LI9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clp1Q99LI9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms