Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx15Q91WE1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx15Q91WE1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms