Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rassf9Q8K342 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms