Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc30Q8BVF4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms