Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Npm2Q80W85 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Npm2Q80W85 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Npm2Q80W85 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms