Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6aQ78XR0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6aQ78XR0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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