Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms