Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ScapQ6GQT6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ScapQ6GQT6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ScapQ6GQT6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ScapQ6GQT6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ScapQ6GQT6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ScapQ6GQT6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ScapQ6GQT6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ScapQ6GQT6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ScapQ6GQT6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ScapQ6GQT6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms