Protein–RNA interactions for Protein: Q6A098

Secisbp2l, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2lQ6A098 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2lQ6A098 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2lQ6A098 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms