Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf260Q62513 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Znf260Q62513 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Znf260Q62513 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Znf260Q62513 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Znf260Q62513 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf260Q62513 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms