Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mkrn3Q60764 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms